想要玩LAMMPS，首先你得安装LAMMPS，所以本blog的第一篇文章是Linux版LAMMPS安装总结（个人电脑版+离线服务器版）
一.个人电脑版（只要是linux系统即可，不分centos还是ubuntu，把网连好就可以开始了）
1.以管理员身份先装一些必备的辅助软件
注：以下指令输入时要注意空格~ #号后面全是注释
(以ubuntu系统为例，centos应该是sudo yum -y install xxxx)
sudo apt-get upgrade
sudo apt install build-essential
sudo apt install g++
sudo apt install gcc
sudo apt install gfortran
2.以管理员身份安装fftw，mpich，不需要设置环境变量（管理员身份表示默认设置环境变量）~
ps:建议专弄一个空的文件夹用于存放安装mpich,fftw以及LAMMPS
mpich3的安装流程与介绍的fftw3一样
tar -zxvf fftw-3.3.8.tar.gz #下载好安装包后进行解压
cd fftw-3.3.8 #进入解压后的文件夹
sudo ./configure #配置阶段
sudo make (或者输入make -j 4)编译阶段，单核就输入make就行，不过会有点慢，多核就输入make -j n (n为核数)
sudo make install #最后安装
以防万一，安装完后检查一下~
which mpirun
which fftw-wisdom
3.安装LAMMPS
tar -zxvf lammps-stable.tar.gz #解压文件
cd lammps-3Mar20/src/ #进入解压后文件夹钟的src文件夹里面
make ps #查看所支持的包，不出意外应该全是no
make yes-manybody正式编译前把所需要的包装上，例如这里安装manybody这个包
make mpi #最后正式安装
安装成功后目录下会出现lmp_mpi这个文件，如果找不到，则表示安装失败~
安装成功后设置如下（这个操作只适合个人电脑以及有服务器管理员权限的同学）~
sudo cp lmp_mpi /usr/local/bin (或者/usr/bin)
相当win下将文件与拷贝到桌面，便于随时调用
which lmp_mpi #检查一下
PS：
有同学肯定会疑惑，我刚学，不知道哪些包需要，这点不需要担心，可以先啥包都不装，或者就装个manybody包也行，先走个安装流程，再运行个例子玩玩，后期知道自己需要什么包之后再重新补包即可（注意，有些包的安装不是简单的make yes就能搞定的，需要仔细阅读包中的README，查看对应的安装操作，例如voronoi包，则需要额外下载vornoni软件进行支持才能安装）~
需要什么包装什么包，别想着一次性装完，不现实~
一般可根据自己需要用到的命令从手册中查到这个命令需要什么包
常规补包流程：
make clean-all
make yes-xxx
make yes-xxx
…..
make mpi
最后更新下调用的lmp_mpi，不更新则永远调用的是以前的lmp_mpi
sudo cp lmp_mpi /usr/local/bin (或者/usr/bin)
直接覆盖以前的旧版~
或者
sudo cp lmp_mpi /usr/local/bin/lmp_mpi_new (或者/usr/bin/lmp_mpi_new)即把新编译得到的lmp_mpi换个名字与之前的旧版共存，想调用哪个用哪个~
二：离线服务器版（适合各大超算平台以及组内无网的服务器）
1.检查一下能否调用g++，gcc，gfortran等编译器
即输入（即检查是不是能随时随地调用g++，gcc，gfortran）：
which g++
which gfortran
which gcc
看看有没有路径输出来（这些常见的编译器在各大超算平台都已装好，直接调用即可），没有的话，则询问服务器管理员，或者自行百度下载安装包后上传服务器后安装直到能随时调用~
2.安装fftw3以及mpich3（mpich3的安装流程与介绍的fftw3一样）
注：此过程若是报错，95%都是因为gfortran这类的编译器没装好，或者不能直接调用~
cd fftw-3.3.8 #进入解压后的文件夹
./configure —prefix=xxx/xxx/xxx配置阶段，xxx/xxx/xxx为自定义的目录路径，选个空间够的位置就行
make (或者输入make -j 4)
编译阶段，单核就输入make就行，不过会有点慢，多核就输入make -j n (n为核数)
make install #最后安装
3.设置环境变量
注：此过程目的既是让mpirun以及fftw能随时被调用（即类似于win下安装软件时，最后一步一般会问你要不要在桌面创建快捷方式，创建了快捷方式，我们用软件就很方便，就不需要每次用的时候都要进入安装目录里面去找，直接在桌面点击即可~）
vi ~/.bashrc
对fftw
export PATH=x/x/x/bin/:$PATH
x/x/x为自定义的目录路径
export LD_LIBRARY_PATH=x/x/x/lib/:$LD_LIBRARY_PATH
对mpich（与fftw一样的设置）
export PATH=x/x/x/bin/:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=x/x/x/lib/:$LD_LIBRARY_PATH
写完之后保存退出（:wq）
source ~/.bashrc#激活设定
查一下是否设定成功
which mpirun
which fftw-wisdom
输入以上语句后看看有没有路径输出，有则成功，没有就重装或者检查环境变量的设置吧~
4.安装LAMMPS
以3Mar20版为例，建议把LAMMPS，mpich，fftw等安装包放在同一目录下，方便管理
tar -zxvf lammps-stable.tar.gz #解压文件
cd lammps-3Mar20/src/ #进入解压后文件夹钟的src文件夹里面
make ps查看所支持的包，不出意外应该全是no,跟个人电脑版里的说明一样，需要什么包装什么包
make yes-manybody
正式编译前把所需要的包装上，例如这里安装manybody这个包
make mpi #最后正式安装
安装结束后看看能不能在src文件夹里面找到lmp_mpi这个编译安装得到的LAMMPS可执行文件，能找到则安装成功，找不到则排除问题重新安装~
最后设置下环境变量，让lmp_mpi可以随时被调用~
vi ~/.bashrc
export PATH=xxx/xxx/xxx/src:$PATH
source ~/.basrc#激活设定
最后输入
which lmp_mpi
看看能否出现类似路径，出现则设定成功~
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